ANALISIS DE DIVERSIDAD GENETICA DE 64 VARIEDADES DE JAMAICA (HIBISCUS SABDARIFFA L.) MEDIANTE MARCADORES MOLECULARES

Abstract

El cultivo de Jamaica (Hibiscus sabdariffa L.) es originaria de África, pertenece ala familia Malvaceae. En nuestro país, es cultivada en 15 estados de la República. La diversidad genética presente en las variedades actualmente utilizadas esta dada principalmente por cruzamientos naturales y selección; no obstante, existe un vació en la identificación varietal, estudios sobre diversidad y estructura genética de las mismas. Aunque existen algunos estudios a nivel internacional, el numero de muestras utilizado ha sido limitado o se han enfocado en otras especies de Hibiscus. Por tal motivo, es necesario estimar la diversidad genética de las variedades de Jamaica tanto a nivel morfológico como molecular. El objetivo del presente trabajo fue estimar mediante el uso de marcadores moleculares, los niveles de diversidad genética presentes en 64 accesión es de Jamaica (Hibiscus sabdariffa L.).Se incluyeron 64 accesiones originarias de Nayarit, Guerrero, Colima y Puebla. El DNA genomico se obtuvo a partir de tejido foliar liofilizado mediante el método de CTAB modificado. Para el análisis molecular se utilizaron las combinaciones de primers derivados del Citocromo P450, CYP2B6F/CYP1A1 R, CYP1A1F/CYP2B6R, CYP1A1F/CYP2C19R, CYP2C19F/CYP2C19R, CYP2B6F/CYP2B6R Y CYP2B6F/CYP2C19R, además se amplificaron cinco combinaciones de AFLPs las cuales fueron altamente informativas Eco RI + AAG/Mse I + CAC, Eco RI + ACG/Mse I + CAAG, Eco RI + AAG/Mse 1+ CAG, Eco RI+ ACG/Mse I +CAGC y Eco RI + AAG/Mse I + CGC. Los fragmentos amplificados se visualizaron en geles de poliacrilamida (8%). Los parámetros básicos de diversidad genética y el análisis de coordenadas principales (PCoA) fueron realizados con el software GenAlEx 6.5. El fonograma se construyó con la matriz de distancias genéticas empleando la metodología de Neighbor-Joining (N-J), con el software Mega 5.2. Los resultados de las combinaciones del CYP450 indicaron 82.65% de polimorfismo y 0.403 de heterocigosidad esperada total, siendo esta ultima considera como moderada a alta, en comparación con otros resultados reportados previamente (0.305, empleando marcadores AFLP·s). A través del PCoA se explicó el 74.76% de la variación genética, mientras que en el fenograma N-J las muestras de Jamaica fueron separadas en tres grupos principales y cada uno con dos subgrupos y subdivisiones. Este último análisis separo claramente los progenitores que dieron origen a los materiales de Nayarit, ubicándolos en los extremos opuestos del fonograma, mientras que el resto de los materiales no mostraron ninguna tendencia en la agrupación. En el caso de los AFLPs se observó un 86.57 % de polimorfismo, con un promedio de 32.4 loci polimorficos por combinación de marcadores, la diversidad genética de (Nei) fue de 0.310, valores similares a los reportados en otros estudios (0.305, también con marcadores AFLPs). Se estableció que no hay genotipos duplicados en la colección, sin embargo, existe un grado de parentesco elevado en los materiales de acuerdo a la dispersión del fenograma.